fiji:rib sanner$ about 3c9w_ligandWithSideChain_random_covalent.dro

docking result file

  date       : Thu Sep 28 12:23:26 2017

  node       : fiji.scripps.edu

  platform   : Darwin-14.3.0-x86_64-i386-64bit

  ncores     : 4

 

  receptor   : 3c9w_cov_cmdline.trg

   docking target file

     date       : Fri Dec 16 17:56:21 2016

     node       : fiji.scripps.edu

     platform   : Darwin-14.3.0-x86_64-i386-64bit

 

     receptor   : 3c9w.pdbqt

       FlexRec  : None

       covBond  : [A:CYS164:N (1591)] A:CYS164:CA (1593) -- A:CYS164:CB (1596)

       coords   : [23.521, 5.081, 12.263] [24.700, 4.867, 11.312] [23.696, 4.237, 13.432]

       covRes   : A:CYS164

       covFile  : covalenLig.pdbqt

       ignAtms  : [1592, 1595, 1596, 3349, 3350, 3351, 3352, 3353, 3354, 3355, 3356, 3357, 3358, 3359, 3360, 3361, 3362, 3363, 3364, 3365, 3366, 3367, 3368, 3369, 3370, 3371, 3372, 3373, 3374, 3375, 3376, 3377, 3378]

 

     box        : 

       center   : 28.565 6.329 6.985

       length   : 22.500 22.500 22.500

       size     : 0060 0060 0060

       spacing  : 0.375

 

     maps       :   A  Br   C  Ca  Cl   d   e   F  Fe   G  GA   H  HD  HS   I   J  Mg  Mn   N  NA  NS  OA  OS   P   Q   S  SA   Z  Zn

     pocketMode : ['user', '28.565', '6.329', '6.985', '22.5', '22.5', '22.5']

       #fillpts : 191 points

       file     : 3c9w_cov_cmdline/translationPoints.npy

 

  ligand     : 3c9w_ligandWithSideChain_random.pdbqt

     nbAtoms : 34

     types   : A:6 C:16 OA:8 HD:3 SA:1

  lig ref    : None

  summary    : 3c9w_ligandWithSideChain_random_covalent_summary.dlg

  GA params  :

    maxEvals : 100000

    nbRuns   : 50

    jobName  : covalent

    seed     : 1

    covLig   : [1, 2, 3]